Junta Directiva
Cuando la Asamblea General no sesiona, la Junta Directiva es la autoridad máxima de la UCCAP y está conformada por representantes de cada una de las organizaciones psicológicas, este representante puede ser el presidente u otro de los dos asambleístas, que cuenta con el apoyo total de la junta directiva de la organización nacional.
La presidencia de la junta directiva y demás cargos, no son electos por votación, sino mediante un sistema de rotación, donde cada país tendrá la presidencia de la UCCAP, una vez cada cinco años.
Dirección Ejecutiva
La dirección ejecutiva es el único puesto elegido por la asamblea general de UCCAP, y cumple con un periodo de 3 años, reelegibles por los períodos que la asamblea estime oportuno.
Posee entre sus funciones gerenciar los programas, proyectos y oficinas de la federación centroamericana. Para lograr un desempeño óptimo tiene la facultad de crear estructuras administrativas, asesoras, técnicas y de representación.
Al momento se ha creado una estructura técnica, la Comisión Regional de Comunicación.
